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  • fstat() — Get status information about a file - IBM
    Gets status information about the file specified by the open file descriptor fildes and stores it in the area of memory indicated by the info argument The status information is returned in a stat structure, as defined in the sys stat h header file The elements of this structure are described in stat () — Get file information
  • vcfstats - GitHub Pages
    vcfstats uses plotnine for plotting, read more about it on how to specify --ggs to modify the plots # or # require vcf file to be tabix-indexed You can plot the distribution, using density plot or histogram See more examples: https: github com pwwang vcfstats issues 15#issuecomment-1029367903
  • GitHub - pwwang vcfstats: Powerful statistics for VCF files
    There are a couple of tools that can plot some statistics of VCF files, including bcftools and jvarkit However, none of them could: R package vcfR can do some of the above However, it has to load entire VCF into memory, which is not friendly to large VCF files Or run with docker: -w vcfstats workdir \ -v $(pwd): vcfstats workdir \
  • _fstat、_fstat32、_fstat64、_fstati64、_fstat32i64、_fstat64i32
    _fstat 函数可获取有关与 fd 关联的打开文件的信息，并将其存储在 buffer 指向的结构中。 SYS\Stat h 中定义的 _stat 结构包含下列字段。 上次文件访问的时间。 文件的创建时间。 如果是设备，则为 fd；否则为 0。 文件模式信息的位掩码。 如果 fd 指的是设备，则设置 _S_IFCHR 位。 如果 fd 指的是普通文件，则设置 _S_IFREG 位。 将根据文件的权限模式设置读 写位。 在 SYS\Stat h 中定义 _S_IFCHR 和其他常量。 上次进行文件修改的时间。 在非 NTFS 文件系统上始终为 1。 如果是设备，则为 fd；否则为 0。 文件的大小（字节）。
  • biopet vcfstats - GitHub
    Vcfstats is a tool that can generate metrics from a vcf file This tool can run locally single threaded but also on a Apache Spark cluster For documentation and manuals visit our github io page VcfStats is part of BIOPET tool suite that is developed at LUMC by the SASC team
  • 理解Linux系统调用：stat、fstat与struct stat详解-CSDN博客
    stat系统调用系列包括了fstat、stat和lstat，它们都是用来返回“相关文件状态信息”的，三者的不同之处在于设定源文件的方式不同。 由文件描述符取得文件的状态。 stat、lstat、chmod、 chown 、readlink、utime。 fstat () 用来将参数filedes 所指向的文件状态复制到参数buf 所指向的结构中 (struct stat), fstat () 与stat () 作用完全相同，不同之处在于传入的参数为已打开的文件描述符。 执行成功返回0，失败返回-1，错误代码保存在errno中。
  • Command-line arguments - vcfstats - GitHub Pages
    vcfstats v0 2 0: Powerful VCF statistics vcfstats --vcf PATH --outdir AUTO --formula LIST --title LIST [OPTIONS] -v, --vcf <PATH> - The VCF file -o, --outdir <AUTO> - The output directory -f, --formula <LIST> - The formulas for plotting in format of Y ~ X, where Y and X should be either an entry or an aggregation
  • VcfStat vcf_var_stat. pl at master - GitHub
    use strict; use warnings; use Getopt::Long; my ($vcf,$out,$keepList,$all,$CHROM); my $usage = "USAGE:\nperl $0 --vcf <vcf> --out <out> --keep <keep list> --all --chr <keep chr>\n"; $usage = "<vcf> is the input vcf fle [Necessary] \n"; $usage = "<out> is the output file [Necessary]\n"; $usage = "<keep list> is a list of samples to be keep





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